فهرست مطالب
چکیده فارسی.............................................................................................................................................................................................ذ
چکیده انگلیسی..........................................................................................................................................................................................ر
1-1 مقدمه ............................................................................................................................. 2
2-1 نشان گر چیست؟ ................................................................................................................. 2
3-1 انواع نشان گرهای ژنتیکی ....................................................................................................... 3
1-3-1 نشان گرهای مورفولوژیک ................................................................................................ 3
2-3-1 نشان گرهای پروتئینی ................................................................................................... 4
3-3-1 نشان گرهای مولکولی DNA و RNA .................................................................................. 4
1-3-3-1 نشان گرهای غیر مبتنی بر PCR ................................................................................... 7
1-1-3-3-1 تفاوت طول قطعات حاصل از هضم DNA توسط آنزیم های محدودگر) (RFLP ........................ 7
2-1-3-3-1 پویش ژنومی نشانه های هضم ) RLGS ) ........................................................................ 8
3-1-3-3-1 ماهوارک ها .......................................................................................................... 9
2-3-3-1 نشان گرهای مبتنی بر PCR ...................................................................................... 11
1-2-3-3-1 تفاوت طول قطعه های حاصل از تکثیر ) AFLP ) ............................................................ 11
2-2-3-3-1 DNA چندشکل تکثیرشده ی تصادفی ) RAPD ) .......................................................... 13
3-2-3-3-1 تفاوت تک نوکلئوتیدی (SNP) ................................................................................ 13
4-2-3-3-1 نشان گرهای مبتنی برنقاط نشان مند از ردیف ) STS ) ...................................................... 14
1-4-2-3-3-1 تفاوت طول قطعه های قابل تکثیر) ALP ) ................................................................. 11
2-4-2-3-3-1 ریزماهواره ها ................................................................................................... 11
4-1 فراوانی، توزیع و سازماندهی ریزماهواره ها در داخل ژنوم ................................................................. 11
1-1 مکانیسم ایجاد تنوع در طول توالی های تکراری ........................................................................... 11
1-1-1 کراسینگ اور نابرابر ..................................................................................................... 17
2-1-1 عدم جفت شدن ناشی از سرخوردن DNA در طول رشته )خطاهای همانند سازی( .......................... 17
1-1 دامنه تنوع واحدهای تکرارشونده ............................................................................................ 19
1-1-1 مدل جهش گام به گام ................................................................................................. 19
2-1-1 مدل آللی ن امحدود ..................................................................................................... 19
7-1 مارکرهای STR ............................................................................................................... 22
8-1 کاربرد مارکرهای STR ....................................................................................................... 22
1-8-1 مطالعات شجره ای و روابط فامیلی .................................................................................... 22
2-8-1 شناسایی هویت قربانیان حوادث ..................................................................................... 21
3-8-1 تعیین هویت در موارد جنایی ......................................................................................... 22
1-3-8-1 شناسایی افراد مجهول الهویه ...................................................................................... 22
2-3-8-1 ردیابی مجرمین ..................................................................................................... 22
4-8-1 ردیابی تاریخ بشر و مطالعات جمعیتی ............................................................................... 23
9-1 سایر کاربردهای مارکرهای STR ........................................................................................... 21
1-9-1 جمع آوری سلول های جنینی از خون مادر .......................................................................... 21
ج
2-9-1 نقشه ی ژنوم بیماری ها ................................................................................................. 21
3-9-1 تعیین هویت افراد استفاده کننده از سرنگ مشترک .............................................................. 21
4-9-1 تشخیص کلون های موفق .............................................................................................. 21
1-9-1 بررسی و نظارت روی پیوند عضو ..................................................................................... 21
1-9-1 تشخیص کایمرهای ژنتیکی ........................................................................................... 21
7-9-1 مشخص نمودن خطوط سلولی ....................................................................................... 27
8-9-1 تشخیص تومورهای سرطانی .......................................................................................... 27
12-1 روش های کلی شناسایی هویت افراد در سطح مولکولی ................................................................ 27
1-12-1 روش انگشت نگاری ژنتیکی از طریق هیبرید کردن با DNA جستجوگر ...................................... 27
1-1-12-1 محدودیت های روش انگشت نگاری .............................................................................. 29
2-12-1 روش پروفایلینگ ..................................................................................................... 29
11-1 تاریخچه استفاده از مارکرهای STR ....................................................................................... 32
12-1 CODIS چیست؟ ........................................................................................................... 31
13-1 کیت مورد استفاده در تعیین هویت ....................................................................................... 32
14-1 معرفی استان ها .............................................................................................................. 34
1-14-1 استان کرمانشاه ....................................................................................................... 34
1-1-14-1 موقعیت جغرافیایی ................................................................................................ 34
2-14-1 استان یَزد .............................................................................................................. 31
1-2-14-1 موقعیت جغرافیایی ................................................................................................ 31
11-1 هدف از تحقیق: .............................................................................................................. 37
فصل دوم ............................................................................................................................. 38
1-2 نمونه گیری ..................................................................................................................... 39
2-2 استخراج DNA به روش نمک اشباع ....................................................................................... 39
3-2 آماده سازی نمونه ها جهت انجام تست DNA Typing .................................................................. 42
1-3-2 رسوب گذاری با اتانول .................................................................................................. 41
2-3-2 تعیین غلظت نمونه های DNA توسط دستگاه Nanodrop ..................................................... 42
3-3-2 تهیه ی Working Stoke ............................................................................................ 42
4-2 تست DNA Typing ........................................................................................................ 43
1-4-2 Multiplex PCR ..................................................................................................... 43
1-2 مواد و تجهیزات مورد نیاز در DNA Typing ............................................................................ 44
1-1-2 آزمایش DNA Typing .............................................................................................. 44
2-1-2 جداسازی قطعات ....................................................................................................... 41
1-2-1-2 تجهیزات لازم ........................................................................................................ 41
2-2-1-2 آماده سازی دستگاه جهت جداسازی قطعات ..................................................................... 41
3-2-1-2 روش جداسازی قطعات ............................................................................................ 41
1-2 آنالیز داده ها .................................................................................................................... 47
1-3 نمونه ها .......................................................................................................................... 13
2-3 پروفایل ژنتیکی ................................................................................................................ 13
2-3 نتایج حاصل از آنالیز نمونه ها ................................................................................................ 11
ح
3-3 نتایج حاصل از آنالیز نمونه های کرمانشاه .................................................................................. 11
4-3 نتایج حاصل از آنالیز نمونه های یزد ......................................................................................... 12
فصل چهارم .......................................................................................................................... 11
1-4 بحث .............................................................................................................................. 11
2-4 نتیجه گیری ..................................................................................................................... 73
3-4 پیشنهادات ..................................................................................................................... 73
منابع انگلیسی ........................................................................................................................ 74
منابع فارسی......................................................................................................................... 57

فهرست جداول
1 انواع نشان گرهای ژنتیکی - شکل 1 ] 12 [ ........................................................................................ 7
1 جایگاه های موجود در کیت - جدول 1 ABI ................................................................................... 33
1 محلول - جدول 2 I استخراج DNA )محلول لیز کننده گلبول های قرمز( .................................................... 39
2 محلول - جدول 2 II استخراج DNA )محلول لیز کننده گلبول های سفید( ............................................... 42
3 ترکیبات - جدول 2 TE ........................................................................................................... 42
4 شرایط - جدول 2 PCR .......................................................................................................... 41
1 تنظیمات دستگاه - جدول 2 ABI3130 در جداسازی قطعات STR ...................................................... 41
] 4 چگونگی عملکرد دستگاه الکتروفورز موئینه ای] 21 - شکل 2 ................................................................ 47
1 مواد فلورسنت موجود در کیت - جدول 2 ABI و رنگهایشان ............................................................... 48
] 1 مواد مختلف در طول موج های متفاوتی نور خود را ساطع می کنند] 21 - شکل 2 ........................................ 48
] 7 ماده فلورسنت مورد استفاده برای هر جایگاه] 21 - جدول 2 ............................................................... 49
1 پروفایل ژنتیکی یک فرد - شکل 3 ............................................................................................... 14
2 فراوانی آللی و سایر پارامترهای جمعیتی و پزشکی قانونی در جمعیت یزد را نشان می دهد. - جدول 3 ................ 12
1 مقایسه جمعیت کرمانشاه با سایر جمعیت ها - جدول 4 ...................................................................... 17
2 مقایسه جمعیت یزد با سایر جمعیت ها - جدول 4 ............................................................................. 18
د
فهرست شکل ها
2 کراسینگ آور و مبادلات نابرابر بین کروماتیدهای خواهری سبب ایجاد حذف شدگی یا الحاق می شود - شکل 1 ] 23 .[ ........... 17
3 متزلزل بودن پلی مراز حین همانندسازی - شکل 1 DNA می تواند طول تکرار را به اندازه یک یا دو واحد تغییر دهد ]23[ . .. 18
4 آلل های فرزندان مجموعه ای از آلل های والدین آنها می باشد - شکل 1 [ 6 ]2 . ............................................. 21
شکل 1-1 شناسائی مجرمین به کمک مارکرهای STR [ 26 ] . .............................................................. 23
1 مراحل انگشت نگاری ژنتیکی - شکل 1 [ 38 ] . ................................................................................. 28
7 مراحل پروفایلینگ - شکل 1 DNA [ 36 ] . .................................................................................... 32
8 جایگاه های - شکل 1 CODIS روی کروموزوم های انسان] 25 ] . ............................................................ 32
9 موقعیت جغرافیائی استان کرمانشاه - شکل 1 [ 44 ] . ......................................................................... 31
12 موقعیت جغرافیائی استان یزد] - شکل 1 45 ] . ............................................................................... 31
2 استفاده از - شکل 2 Multiplex PCR ] در روش پروفایلینگ] 31 .......................................................... 44
] 3 دستگاه الکتروفورز موئینه ای] 11 - شکل 2 ................................................................................... 41
6- شکل 2 ladder به کاررفته در کیت ABI ]21[ ............................................................................... 12
] 1 درخت فیلوژنتیکی میان سیزده جمعیت مختلف] 41 - شکل 4 ............................................................ 71
] 2.درخت فیلوژنتیکی میان نه جمعیت مختلف] 41 - شکل 4 .................................................................. 71
ذ
فهرست نمودار ها
1 پارامترهای ژنتیکی جمعیت استان کرمانشاه برحسب درصد - نمودار 3 ..................................................... 12
2 پارامترهای ژنتیک جمعیت استان یزد برحسب درصد - نمودار 3 ............................................................ 14
ر
چکیده
بررسی تنوع ژنتیکی اقوام ایرانی با استفاده از STR
مونا داودبیگی
بررسی تنوع ژنتیکی در جمعیت ها با استفاده ار تعیین فراوانی آللی و پارامترهای ژنتیکی روش نوینی است که در
سال های گذشته در بسیاری از جمعیت های جهان صورت گرفته و با استفاده از آن شباهت بسیاری از جمعیت ها به
یکدیگر مشخص گردیده. شباهت جمعیت ها نشان دهنده ی همسان بودن خزانه ی ژنتیکی آنها و احتمالا یکسان بودن آن
جمعیت ها در گذشته است. پس این احتمال وجود دارد که این جمعیت ها در گذشته یک جمعیت بوده باشند 

و.........